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68 artículos

In-situ Target Base Editing Combining with Biosensor-driven Strategy Reveals Critical Single Nucleotide Variants for Enhanced Recombinant Protein Secretion in Pichia pastoris

Los investigadores desarrollaron una estrategia innovadora que combina la edición genómica in situ mediada por editores de bases con un biosensor impulsado por nanocuerpos para identificar variantes de nucleótido único críticas que mejoran significativamente la secreción de proteínas recombinantes en *Pichia pastoris*, logrando un récord de producción de albúmina sérica humana.

Tang, Y., Zhang, C.2026-04-10📄 synthetic biology

Multicenter preclinical validation of next-generation CAR T cells: a strategy for harmonization, reproducibility, and its feasibility in clinical translation

Este estudio valida la viabilidad de ensayos preclínicos multicéntricos armonizados para confirmar que la sobreexpresión de CCR8 en células CAR-T mejora su migración hacia tumores sólidos sin comprometer su actividad, estableciendo un marco para reducir el riesgo en la traducción clínica.

Dalloul, I., Barden, M., Wilcke, J. + 5 more2026-04-10📄 synthetic biology

Expression landscape of heterologous enzymes in Synechocystis sp. PCC 6803

Este estudio cuantifica por primera vez la degradación de proteínas heterólogas en *Synechocystis* sp. PCC 6803 mediante un nuevo enfoque de reporte con split-GFP y CRISPRi, revelando que casi la mitad de las enzimas se degradan significativamente y que sustituir las enzimas por homólogos es a menudo más efectivo que optimizar los elementos genéticos para mejorar la producción en biorreactores fotosintéticos.

Medipally, H., Karlsson, A., Dheer, A. + 2 more2026-04-09📄 synthetic biology

Sequence Design and Phylogenetic Inference with Generative Flow Networks

Este trabajo presenta AncestorGFN, un enfoque basado en redes de flujo generativo (GFlowNets) que realiza simultáneamente la generación de secuencias y la inferencia filogenética sin necesidad de alineamientos múltiples, demostrando su capacidad para recuperar patrones de ascendencia común y diseñar nuevas secuencias en el caso de estudio de la familia de microARN let-7.

Huang, Q., Mourra-Diaz, C. M., Wen, X. + 1 more2026-04-09📄 synthetic biology

Automated Knowledge Graph Construction for CAR T Cell Receptor Design via Hybrid Text Mining

Este trabajo presenta un flujo de trabajo automatizado que integra herramientas de procesamiento de lenguaje natural y modelos de lenguaje grande para construir un grafo de conocimiento dirigido de ~7.500 interacciones a partir de la literatura científica, facilitando así el diseño racional de receptores de antígeno quimérico (CAR) de próxima generación.

Luo, H., Tang, D., Zivanov, A. + 1 more2026-04-07📄 synthetic biology

End-to-end bimodal anti-counterfeiting by informational DNA nanoparticles

Este artículo presenta InfinMark, un marco de esteganografía de ADN de extremo a extremo que integra el Internet de las Cosas (IoT) y el ADN de las Cosas (DoT) mediante nanopartículas de ADN para crear un sistema de anti-falsificación bimodal completo que abarca desde la codificación de información y el marcado invisible hasta la autenticación rápida en múltiples niveles.

He, T., Zhuo, B., Zhao, X. + 15 more2026-04-07📄 synthetic biology

DNA Protonuclei as Programmable Nuclear Mimics Reveal Environmental Context on Protein Phase Separation

Este estudio introduce protonúcleos programables de ADN como miméticos nucleares que revelan cómo el contexto ambiental, como la confinación espacial y las propiedades viscoelásticas, modula la separación de fases de la proteína FUS de manera que los ensayos tradicionales no pueden predecir, permitiendo así controlar la transición líquido-sólido asociada a enfermedades neurodegenerativas.

Dormann, D., Walther, A., Fritzen, J. + 3 more2026-04-07📄 synthetic biology

Gain-Scheduled Optogenetic Feedback for Disturbance Rejection in Bacterial Batch Cultures

Este artículo presenta un marco de control de retroalimentación óptico-genética basado en un modelo multiescala que utiliza estrategias de programación de ganancia para superar las limitaciones de los controladores fijos y lograr un rechazo robusto de perturbaciones en cultivos bacterianos por lotes, adaptándose dinámicamente a los cambios en el estado fisiológico celular durante las fases de crecimiento.

Namboothiri, H. R., Hu, C. Y.2026-04-05📄 synthetic biology

Humanization of the rpb9 locus in fission yeast reveals conserved and divergent roles of rpb9 and human POLR2I

Este estudio demuestra que la humanización endógena del locus *rpb9* en la levadura *Schizosaccharomyces pombe* revela que la proteína humana POLR2I complementa tanto funciones conservadas como roles novedosos en la formación de heterocromatina y la resistencia a fármacos, aunque su capacidad para suplir la resistencia al 6-azauracilo depende de la expresión ectópica.

Finkel, J. M., Williams, M. G., Nirmal, M. B. + 6 more2026-04-04📄 synthetic biology

Surface Display For Phage Assisted Continuous Evolution: A Platform For Evolving / Screening Nanobodies In Prokaryote Systems

Este artículo presenta SurPhACE, una plataforma de evolución continua que combina la presentación en la superficie de *E. coli* con el fago {Phi}X174 para generar y seleccionar nanocuerpos de alto rendimiento en sistemas procariotas, eliminando la necesidad de bibliotecas extensas y procesos de selección tradicionales.

Flores-Mora, F. E., Brodsky, J., Cerna, G. M. + 3 more2026-04-04📄 synthetic biology

Global Quantitative Analysis of Ligation Reactions in Self-Assembled DNA Nanostructures at the Single-Nick Level

Este estudio presenta un análisis cuantitativo global de las reacciones de ligación en nanoestructuras de ADN autoensambladas a nivel de single-nick mediante qPCR, revelando que la eficiencia de ligación depende de la probabilidad de acoplamiento de la enzima en los bordes frente a los sitios internos, un efecto que puede mitigarse utilizando DMSO como cosolvente.

Hacker, K., Juricke, E., Munch, C. + 3 more2026-04-01📄 synthetic biology

Anti-CRISPR-mediated continuous directed evolution of CRISPR-Cas9 in human cells

Este estudio presenta CRISPR-MACE, una plataforma que permite la evolución dirigida continua de la Cas9 directamente en células humanas mediante la selección mediada por proteínas anti-CRISPR, logrando así generar variantes con funciones mejoradas y resistencia a inhibidores que no se pueden obtener mediante métodos tradicionales en bacterias.

Sabol, A. L., Mengiste, A. A., Singh, P. + 15 more2026-04-01📄 synthetic biology

Mathematical modeling and sensitivity analysis of synNotch-CAR T-cells identify engineering targets for dynamic tunability

Este estudio desarrolla modelos matemáticos y realiza un análisis de sensibilidad global para identificar los parámetros clave, como la asociación de ligandos y la fuerza del promotor, que pueden ser ingenierizados para optimizar la dinámica y la sintonización de las células T con receptores synNotch-CAR en terapias contra el cáncer.

Diefes, A. J., Sbaiti, B., Ciocanel, M.-V. + 1 more2026-04-01📄 synthetic biology